38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1491 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1491  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1228    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.287152  normal  0.0494428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4498  hypothetical protein  73.76 
 
 		 605 aa  886    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  31.13 
 
 		 557 aa  236  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1755  hypothetical protein  38.8 
 
 		 686 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6673  hypothetical protein  37.36 
 
 		 663 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.792447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0038  amine oxidase  23.19 
 
 		 654 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.76 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  22.6 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.77 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  22.6 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  22.6 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  22.22 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  22.22 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  22.22 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  21.93 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  21.79 
 
 		 490 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  20.51 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  20.51 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  21.57 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  20.18 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  20.77 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  20 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  20.18 
 
 		 478 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  20 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  20.22 
 
 		 478 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  20.21 
 
 		 491 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  24.19 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  36.25 
 
 		 698 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  23.72 
 
 		 478 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  29.55 
 
 		 580 aa  48.5  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.83 
 
 		 482 aa  48.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  29.2 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  21.33 
 
 		 564 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  28.24 
 
 		 560 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  28.24 
 
 		 560 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  28.82 
 
 		 560 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  26.11 
 
 		 560 aa  43.9  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  38.24 
 
 		 578 aa  43.9  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>