165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1827 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 526 aa  1094    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  49.24 
 
 		 535 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  48.38 
 
 		 533 aa  534  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  48.39 
 
 		 537 aa  531  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  50.29 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  46.95 
 
 		 533 aa  520  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  45.66 
 
 		 519 aa  492  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  47.12 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  45.16 
 
 		 541 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  42.12 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  40.42 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  36.92 
 
 		 516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  36.92 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  37.81 
 
 		 524 aa  349  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  38.68 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  36.47 
 
 		 531 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  34.46 
 
 		 529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  36.23 
 
 		 535 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  35.85 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  33.4 
 
 		 527 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  34.29 
 
 		 527 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  37.32 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  32.74 
 
 		 507 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  31.2 
 
 		 557 aa  243  7.999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  31.13 
 
 		 492 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  28.14 
 
 		 638 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  28.11 
 
 		 482 aa  191  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  28.11 
 
 		 487 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  29.12 
 
 		 487 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  28.11 
 
 		 482 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  28.11 
 
 		 482 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  28.92 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  28.26 
 
 		 490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  27.86 
 
 		 485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  29.48 
 
 		 491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  30.42 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  28.17 
 
 		 490 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  29.35 
 
 		 478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  25.91 
 
 		 646 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  27.45 
 
 		 490 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.94 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.94 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  26.29 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  25.28 
 
 		 644 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.92 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  25.71 
 
 		 478 aa  160  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.71 
 
 		 478 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.71 
 
 		 478 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.96 
 
 		 478 aa  160  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.92 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.51 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  32.33 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  27.81 
 
 		 564 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  25.14 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  27.53 
 
 		 572 aa  120  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  25.2 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  26.65 
 
 		 624 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  23.58 
 
 		 685 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  23.43 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  26.75 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  41.18 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  22.5 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  23.52 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  22.71 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  23.28 
 
 		 560 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  23.28 
 
 		 560 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.34 
 
 		 528 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  24.27 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  21.52 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  35 
 
 		 645 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  24.03 
 
 		 570 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  22.18 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.15 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  31.73 
 
 		 647 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  31.73 
 
 		 647 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  27.49 
 
 		 592 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  22.41 
 
 		 469 aa  53.9  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3575  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  51.67 
 
 		 736 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  22.18 
 
 		 698 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  27.54 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  22.41 
 
 		 560 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  30.09 
 
 		 647 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.39 
 
 		 496 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  22.56 
 
 		 560 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  22.12 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  25.42 
 
 		 572 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  27.97 
 
 		 619 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  23.84 
 
 		 532 aa  50.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  34 
 
 		 495 aa  50.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  23.31 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  22.12 
 
 		 559 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  31.3 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  33.93 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  44.23 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  28.78 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  27.12 
 
 		 616 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 578 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  37.97 
 
 		 431 aa  47.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  23.4 
 
 		 578 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>