216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1331 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  91.01 
 
 
523 aa  924    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
531 aa  1050    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  58.96 
 
 
527 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 
536 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
547 aa  219  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
537 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  34.19 
 
 
527 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  36.56 
 
 
532 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  36.38 
 
 
532 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
549 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
555 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
552 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
539 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  32.04 
 
 
533 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 
532 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
536 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
536 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
535 aa  190  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
516 aa  190  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
537 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
534 aa  183  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
533 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
530 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.07 
 
 
530 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
536 aa  157  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
531 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  29.23 
 
 
530 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.6 
 
 
531 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
531 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
554 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
559 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 
554 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.73 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  27.17 
 
 
556 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  30.43 
 
 
516 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
505 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 
516 aa  133  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
547 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  33.39 
 
 
504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  30.66 
 
 
520 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
513 aa  123  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
556 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
520 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  30.85 
 
 
526 aa  123  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  30.16 
 
 
535 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
520 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
514 aa  113  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
519 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
532 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
510 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
563 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  31.26 
 
 
529 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
564 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 
565 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
551 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
528 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  32.45 
 
 
499 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  32.45 
 
 
499 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  32.45 
 
 
499 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  28.52 
 
 
545 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
531 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.05 
 
 
510 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
528 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
561 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.25 
 
 
523 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  29.9 
 
 
510 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
530 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.16 
 
 
548 aa  88.6  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
530 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
530 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  24.27 
 
 
421 aa  87  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
523 aa  87  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.39 
 
 
545 aa  86.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
524 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  25.65 
 
 
536 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
521 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.39 
 
 
527 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
528 aa  77  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
531 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
534 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27 
 
 
529 aa  69.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  23.61 
 
 
505 aa  67.8  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
506 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.53 
 
 
535 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
524 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>