53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1245 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 350 aa  730    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0218  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  39.39 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0169  dehydrogenase (flavoproteins)  38.01 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2557  dehydrogenase (flavoproteins)  38.89 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0219  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  34.87 
 
 		 355 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2949  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  38.53 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0173  dehydrogenase (flavoproteins)  34.4 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3923  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  35.03 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3414  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  31.1 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0661  FAD dependent dehydrogenase  28.49 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3408  hypothetical protein  28.63 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0688  FAD dependent dehydrogenase  26.74 
 
 		 364 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  21.94 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  21.08 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  40 
 
 		 469 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  21.63 
 
 		 398 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  20.78 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  42.11 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  58.33 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  58.33 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  58.33 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  58.33 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  51.22 
 
 		 469 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  35.8 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  58.33 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  55.56 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  47.83 
 
 		 576 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  58.33 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  58.33 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  52.94 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  38.46 
 
 		 472 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  38.46 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  47.83 
 
 		 578 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  48.78 
 
 		 480 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 		 473 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  38.46 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  48.78 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0643  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.76 
 
 		 384 aa  43.5  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  37.1 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  38.46 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  27.7 
 
 		 487 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  34.62 
 
 		 469 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  27.7 
 
 		 487 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.94 
 
 		 497 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2156  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  47.5 
 
 		 667 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  55.56 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  50 
 
 		 670 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  33.33 
 
 		 468 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  48.78 
 
 		 491 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  51.43 
 
 		 470 aa  42.7  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  51.43 
 
 		 404 aa  42.7  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>