34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0169 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0169  dehydrogenase (flavoproteins)  100 
 
 		 360 aa  746    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2557  dehydrogenase (flavoproteins)  41.6 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0218  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  40.23 
 
 		 366 aa  298  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0219  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  41.69 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2949  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  41.11 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0173  dehydrogenase (flavoproteins)  39.7 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3923  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  35.43 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3414  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  32.66 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0661  FAD dependent dehydrogenase  29.18 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3408  hypothetical protein  31.47 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0688  FAD dependent dehydrogenase  25.71 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  23.4 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  30.19 
 
 		 997 aa  52.8  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.23 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  51.43 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  38.46 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  51.43 
 
 		 472 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  33.87 
 
 		 506 aa  43.5  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  54.29 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  51.28 
 
 		 624 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.14 
 
 		 618 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.06 
 
 		 453 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.04 
 
 		 646 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 473 aa  42.7  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>