100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0173 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0173  dehydrogenase (flavoproteins)  100 
 
 		 364 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3923  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  45.2 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0169  dehydrogenase (flavoproteins)  39.7 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0218  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  38.51 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2557  dehydrogenase (flavoproteins)  37.91 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0219  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  34.62 
 
 		 355 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2949  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  36.61 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3414  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  38.3 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0661  FAD dependent dehydrogenase  28.76 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3408  hypothetical protein  35.8 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0688  FAD dependent dehydrogenase  26.79 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  68.57 
 
 		 473 aa  49.7  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  68.57 
 
 		 473 aa  49.7  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  23.29 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 472 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.06 
 
 		 891 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  55.56 
 
 		 474 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  62.86 
 
 		 652 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  62.86 
 
 		 671 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  62.86 
 
 		 671 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 473 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  55.56 
 
 		 471 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 477 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 477 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 470 aa  46.6  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  55.56 
 
 		 479 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  62.86 
 
 		 472 aa  46.6  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  46.81 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  55.56 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  60 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.7 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  48.94 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  50 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  55.56 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  55.56 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  55.56 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  55.56 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  33.75 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  55.56 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  46.81 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  46.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  55.56 
 
 		 472 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  46.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  55.56 
 
 		 479 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  46.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  46.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  46.81 
 
 		 472 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  46.81 
 
 		 472 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  46.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  55.56 
 
 		 472 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  46.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  46.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  52.78 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  52.78 
 
 		 473 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 472 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 		 468 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  52.78 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  55.56 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  52.78 
 
 		 465 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 469 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  55.56 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  52.78 
 
 		 472 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 469 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  48.94 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  42.55 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  42.55 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 469 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  42.55 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  43.55 
 
 		 542 aa  43.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 468 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 468 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.68 
 
 		 618 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  48.94 
 
 		 468 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  48.94 
 
 		 468 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  48.94 
 
 		 468 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  29.09 
 
 		 401 aa  43.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  48.94 
 
 		 468 aa  43.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  61.11 
 
 		 453 aa  43.1  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  48.94 
 
 		 485 aa  42.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.43 
 
 		 506 aa  42.7  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>