More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2791 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  63.25 
 
 		 472 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  64.82 
 
 		 469 aa  635    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  79.91 
 
 		 468 aa  792    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  63.25 
 
 		 472 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  80.98 
 
 		 468 aa  796    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  80.77 
 
 		 468 aa  795    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  65.74 
 
 		 472 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  80.98 
 
 		 468 aa  797    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  66.17 
 
 		 472 aa  643    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  63.46 
 
 		 472 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  63.25 
 
 		 472 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  64.96 
 
 		 483 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  65.03 
 
 		 472 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  65.11 
 
 		 477 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 485 aa  1007    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  77.35 
 
 		 469 aa  760    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  64.82 
 
 		 472 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  78.42 
 
 		 469 aa  772    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  80.34 
 
 		 468 aa  795    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  79.91 
 
 		 468 aa  792    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  64.39 
 
 		 469 aa  634    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  82.69 
 
 		 468 aa  822    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  77.85 
 
 		 469 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  65.53 
 
 		 477 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  80.34 
 
 		 468 aa  791    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  64.82 
 
 		 472 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  79.91 
 
 		 468 aa  793    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  65.53 
 
 		 473 aa  638    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  80.34 
 
 		 472 aa  789    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 472 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  65.03 
 
 		 472 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  80.13 
 
 		 468 aa  793    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  78.11 
 
 		 469 aa  765    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  64.1 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  64.1 
 
 		 472 aa  634  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 472 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  63.25 
 
 		 472 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  65.53 
 
 		 472 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  63.89 
 
 		 472 aa  634  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  63.97 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  65.18 
 
 		 473 aa  633  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  63.11 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 472 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  65.03 
 
 		 468 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  64.1 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  65.46 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  65.32 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  63.11 
 
 		 472 aa  631  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  65.46 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  63.54 
 
 		 472 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  62.9 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  65.67 
 
 		 472 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  63.54 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  65.46 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  62.82 
 
 		 472 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  62.9 
 
 		 472 aa  627  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  62.61 
 
 		 472 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  62.61 
 
 		 473 aa  615  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1955  glutamate synthase subunit beta  63.89 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  62.61 
 
 		 472 aa  614  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  63.89 
 
 		 467 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  63.06 
 
 		 475 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  62.18 
 
 		 473 aa  611  9.999999999999999e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  62.61 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  62.61 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004469  glutamate synthase [NADPH] small chain  62.31 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  61.9 
 
 		 481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00925  glutamate synthase subunit beta  61.88 
 
 		 470 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  59.06 
 
 		 470 aa  585  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.09 
 
 		 659 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.3 
 
 		 659 aa  578  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  60.09 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  60.09 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.78 
 
 		 674 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  60.09 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.09 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.09 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.09 
 
 		 659 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  61.32 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  60.17 
 
 		 674 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  57.87 
 
 		 671 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  58.09 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.91 
 
 		 671 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  58.09 
 
 		 652 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.52 
 
 		 653 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.31 
 
 		 653 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.09 
 
 		 653 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.31 
 
 		 653 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.31 
 
 		 653 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  59.18 
 
 		 667 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  57.35 
 
 		 481 aa  549  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2165  glutamate synthase subunit beta  56.16 
 
 		 513 aa  542  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03318  glutamate synthase subunit beta  55.6 
 
 		 493 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  56.96 
 
 		 658 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2257  glutamate synthase subunit beta  55.74 
 
 		 513 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000664143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  55.29 
 
 		 639 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  55.29 
 
 		 639 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  55.29 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>