181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0840 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
401 aa  808    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
399 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.06 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.95 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  26.16 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  24.49 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  24.13 
 
 
452 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.88 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  35.2 
 
 
399 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.34 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  25.22 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 
375 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 
363 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 
453 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  24.94 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 
393 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 
393 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  31.54 
 
 
453 aa  59.7  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  31.54 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  22.89 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  34.45 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  23.17 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.1 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  24.2 
 
 
411 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  24.24 
 
 
398 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  29.73 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  23.93 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  23.29 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 
425 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.3 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  23.49 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  21.47 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  30 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  30 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  34.17 
 
 
435 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.18 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
419 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  29.51 
 
 
402 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  30.08 
 
 
423 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 
402 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  22.41 
 
 
360 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  22.03 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  30.83 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  24.59 
 
 
480 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.45 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  33.07 
 
 
440 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  24 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  32.95 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  32.09 
 
 
457 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  27.8 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  24.08 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  23.08 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  22.4 
 
 
375 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  24.35 
 
 
394 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  33.62 
 
 
405 aa  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 
406 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  22.95 
 
 
425 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  21.15 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.11 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 
485 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  20.8 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  22.35 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  31.3 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2871  monooxygenase FAD-binding protein  27.11 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.618134  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.86 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  31.19 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>