272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0073 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  100 
 
 		 474 aa  956    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  70.44 
 
 		 492 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  66.87 
 
 		 503 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  26.23 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  22.52 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  24.54 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  28.29 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  22.38 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  22.63 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  22.42 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  26.91 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  21.75 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  26.18 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  29.77 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  25.08 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.78 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  25.58 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  28.01 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  27.24 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  40.96 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.79 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  46.67 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  27.99 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  23.62 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  24.1 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  22.38 
 
 		 599 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  26.71 
 
 		 624 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  25.38 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  21.6 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  29.44 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  25.38 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  24.95 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  23.05 
 
 		 511 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  27.1 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  21.18 
 
 		 463 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  28.38 
 
 		 565 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  25.13 
 
 		 416 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.24 
 
 		 511 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  32.01 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  51.92 
 
 		 520 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  25.57 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  49.12 
 
 		 507 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  25.72 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  26.06 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  49.09 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  28.36 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  27.14 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  24.05 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  56.86 
 
 		 527 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.63 
 
 		 592 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  24.05 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  36.47 
 
 		 647 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  25.21 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  36.47 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  26.13 
 
 		 667 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  25.62 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  26.73 
 
 		 619 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  26.73 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  24.76 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  26.3 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  27.04 
 
 		 616 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  39.36 
 
 		 505 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  20.54 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  23.08 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  27.17 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  22.74 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  41.43 
 
 		 359 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  28.39 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  39.36 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  50 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  23.47 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  25.85 
 
 		 535 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  56.82 
 
 		 491 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.14 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  40.68 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  36.64 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  24.87 
 
 		 416 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  54.9 
 
 		 527 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  29.57 
 
 		 476 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1008  putative protoporphyrinogen oxidase  27.09 
 
 		 432 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961775  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  27.09 
 
 		 432 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  27.09 
 
 		 432 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  27.09 
 
 		 432 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  27.09 
 
 		 432 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  36.22 
 
 		 436 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  41.1 
 
 		 512 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  20.85 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  39.18 
 
 		 489 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  44.12 
 
 		 434 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  42.35 
 
 		 506 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  27.07 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  60 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  35.43 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>