71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1802 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  100 
 
 
439 aa  895    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  56.42 
 
 
435 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0884  amine oxidase  55.79 
 
 
438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0152  amine oxidase  41.15 
 
 
439 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  22.07 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  23.39 
 
 
469 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  26.13 
 
 
474 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  24.47 
 
 
396 aa  53.5  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  23.43 
 
 
509 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  21.81 
 
 
469 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  25.58 
 
 
449 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  23.41 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  26.09 
 
 
492 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  24.43 
 
 
461 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  27.34 
 
 
479 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  26.43 
 
 
482 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  40.54 
 
 
445 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  34.67 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  39.29 
 
 
447 aa  47.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  58.54 
 
 
570 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  22.85 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  31.76 
 
 
452 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  25.17 
 
 
479 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 
435 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  37.88 
 
 
467 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
466 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
466 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  24.35 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  34.41 
 
 
542 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  27.59 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  22.08 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  22.25 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  21.94 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  28 
 
 
482 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  25.27 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  40.35 
 
 
475 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  45.65 
 
 
470 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  42.59 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  21.84 
 
 
463 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  42.59 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  48.94 
 
 
416 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  42.59 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.57 
 
 
647 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  34.92 
 
 
488 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  28.1 
 
 
843 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  48.89 
 
 
523 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 
489 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
424 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  25.9 
 
 
483 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  24.54 
 
 
456 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  30.85 
 
 
473 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  23.39 
 
 
503 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  29.49 
 
 
464 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  41.18 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  51.35 
 
 
472 aa  43.9  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  42.86 
 
 
453 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  38.1 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  33.33 
 
 
537 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  31.51 
 
 
488 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  24.02 
 
 
459 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  30.77 
 
 
503 aa  43.5  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  34.92 
 
 
478 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  44.68 
 
 
562 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  26.21 
 
 
486 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.79 
 
 
381 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  45.24 
 
 
371 aa  43.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  29.52 
 
 
451 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>