270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0286 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1008  putative protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
432 aa  833    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961775  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  100 
 
 
432 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
432 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0283  putative oxidoreductase  100 
 
 
1309 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
432 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  100 
 
 
432 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  25.84 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  31.05 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  29.58 
 
 
488 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.32 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  29.08 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  29.09 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  25.87 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  20.36 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  27.31 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  30.56 
 
 
471 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  22.08 
 
 
473 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  23.55 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  28.25 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  30.8 
 
 
420 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  31.55 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  20.57 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  21.48 
 
 
466 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  26.57 
 
 
467 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  20.9 
 
 
466 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26.5 
 
 
492 aa  63.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  25.29 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  27.48 
 
 
490 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  28.2 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  21.19 
 
 
466 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  36.63 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  21.43 
 
 
473 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  21.19 
 
 
466 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  24.07 
 
 
470 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  21 
 
 
473 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  20.4 
 
 
466 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  29.82 
 
 
465 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  29.28 
 
 
460 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  29.8 
 
 
470 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  21.4 
 
 
473 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  31.75 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  27.44 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  38.71 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  27.04 
 
 
470 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  20.67 
 
 
463 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  23.62 
 
 
474 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 
466 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  26.04 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  21.94 
 
 
473 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 
466 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  19.82 
 
 
463 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  32.79 
 
 
463 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  30.66 
 
 
407 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  20.94 
 
 
473 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  20.94 
 
 
473 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  20.94 
 
 
473 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  24.5 
 
 
491 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  31.7 
 
 
444 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  25.84 
 
 
495 aa  56.6  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  31.72 
 
 
394 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  20.82 
 
 
466 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  26.05 
 
 
473 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  24.29 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  24.79 
 
 
472 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  28.47 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  27.97 
 
 
473 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  26.48 
 
 
495 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  27.2 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  34.58 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  27.56 
 
 
454 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  23.25 
 
 
509 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.86 
 
 
647 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  31.07 
 
 
470 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  20.55 
 
 
473 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  40.22 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  26.95 
 
 
448 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  27.04 
 
 
425 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  25.28 
 
 
436 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  27.11 
 
 
456 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  25.83 
 
 
453 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  41.06 
 
 
438 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  35.56 
 
 
464 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  29.67 
 
 
510 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  26.3 
 
 
492 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  22.87 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  28 
 
 
457 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.94 
 
 
487 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  29.41 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  25.1 
 
 
479 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  27.44 
 
 
488 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  25.28 
 
 
436 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  26.49 
 
 
639 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  25.28 
 
 
436 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  29.15 
 
 
452 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  26.55 
 
 
469 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  31.82 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  26.14 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.59 
 
 
490 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>