204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5174 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 470 aa  885    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  75 
 
 		 471 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  49.89 
 
 		 482 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  49.32 
 
 		 479 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  47.62 
 
 		 488 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  47.15 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  47.72 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  49.67 
 
 		 493 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  45.62 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  44.85 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  45.81 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  44.07 
 
 		 469 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  43.11 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  42.41 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  46.14 
 
 		 477 aa  252  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  33.4 
 
 		 473 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  42.89 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  33.48 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  31.85 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  34.39 
 
 		 479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  39.07 
 
 		 488 aa  240  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  31 
 
 		 473 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  31.14 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  42.68 
 
 		 460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  35.48 
 
 		 490 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  30.43 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  31.21 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  31.21 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  31.21 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  31.14 
 
 		 473 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  30.79 
 
 		 473 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  34.42 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  35.71 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  39.96 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  31.21 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  35.28 
 
 		 470 aa  219  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  38.78 
 
 		 421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  31.85 
 
 		 491 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  38.49 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  35.4 
 
 		 459 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  41.51 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  36.64 
 
 		 460 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  27.22 
 
 		 482 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  32.74 
 
 		 476 aa  203  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  29.26 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  29.26 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  26.07 
 
 		 466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  39.16 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  34.71 
 
 		 452 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  34.33 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  36.9 
 
 		 453 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  24.73 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 466 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  24.57 
 
 		 466 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  24.68 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  24.52 
 
 		 466 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  36.85 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  36.85 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  36.62 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  29.23 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  27.74 
 
 		 469 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  28.01 
 
 		 495 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  29.31 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  36.29 
 
 		 479 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  26.05 
 
 		 470 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  30.51 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  28.76 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  26.56 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  29.44 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  29.44 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  31.47 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  29.23 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  31.37 
 
 		 487 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 462 aa  114  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  28.14 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  30.75 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  26.95 
 
 		 482 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.43 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  30.44 
 
 		 502 aa  103  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  29.1 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  28.8 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  24.12 
 
 		 442 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  36.33 
 
 		 531 aa  94  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  30.51 
 
 		 444 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 499 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  27.2 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  29.1 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  22.98 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  21.19 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  28.48 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  25.43 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  26.63 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>