More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1897 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 477 aa  932    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  58.19 
 
 		 488 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  56.73 
 
 		 479 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  52.45 
 
 		 482 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  50.53 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  53.09 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  45.3 
 
 		 471 aa  338  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  46.22 
 
 		 470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  45.13 
 
 		 488 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  46.03 
 
 		 488 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  46.89 
 
 		 475 aa  316  5e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  46.26 
 
 		 482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  44.63 
 
 		 473 aa  302  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  47.25 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  44.9 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  42.57 
 
 		 469 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  46.96 
 
 		 482 aa  269  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  42.13 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  34.67 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  42.7 
 
 		 477 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  30.44 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  41.7 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  36.71 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  33.48 
 
 		 474 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 		 473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  29.81 
 
 		 473 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  29.6 
 
 		 473 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 		 473 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  35.38 
 
 		 488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  29.6 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  29.41 
 
 		 473 aa  230  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  30.63 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  31.53 
 
 		 491 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  35.89 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  28.05 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  37.05 
 
 		 421 aa  214  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  32.54 
 
 		 476 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  35.68 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  28.27 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  37.06 
 
 		 452 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  28.27 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  33.69 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  33.2 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  39.87 
 
 		 454 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  40.04 
 
 		 451 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  40.04 
 
 		 451 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  39.49 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  40.44 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  39.27 
 
 		 475 aa  189  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  33.84 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  34.5 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  31.33 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  25.73 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  25.21 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  29.05 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  25.52 
 
 		 466 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  37.13 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  31.02 
 
 		 467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  24.84 
 
 		 466 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  28.54 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  28.15 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  24.2 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  27.85 
 
 		 467 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  24.2 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  24.2 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  27.94 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  24.84 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  24.42 
 
 		 466 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 		 491 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  28.73 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  28.73 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  27.12 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  27.9 
 
 		 482 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  23.66 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  24.78 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  28.33 
 
 		 469 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  24.62 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  31.05 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  25.92 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  29.32 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  27.69 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  29.26 
 
 		 502 aa  116  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  29.46 
 
 		 487 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  26.6 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 		 454 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  27.8 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  31.15 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  26.5 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3436  protoporphyrinogen oxidase  32.47 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000341133  decreased coverage  0.00125797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  22.8 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4011  protoporphyrinogen oxidase  34.03 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  28.99 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>