141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3250 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 499 aa  937    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  45.2 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  42.17 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  46.15 
 
 		 479 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  39.09 
 
 		 462 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  38.9 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3436  protoporphyrinogen oxidase  46.77 
 
 		 492 aa  217  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000341133  decreased coverage  0.00125797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  36.1 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4011  protoporphyrinogen oxidase  45.11 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  36.04 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  32.57 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  31.3 
 
 		 488 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  31.45 
 
 		 477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  24.8 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  24.8 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  30.06 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  23.72 
 
 		 473 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  25.12 
 
 		 474 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  23.89 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  23.89 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  24.64 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  29.42 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  23.94 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  24.59 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  24.59 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  24.59 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  24.59 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  24.39 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  28.11 
 
 		 479 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  32.56 
 
 		 482 aa  97.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  22.83 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  30.2 
 
 		 473 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  31.29 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  32.25 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  30.19 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  30.52 
 
 		 460 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  28.71 
 
 		 476 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  28.78 
 
 		 453 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  24.43 
 
 		 456 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  26.24 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  28.26 
 
 		 475 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  30.54 
 
 		 482 aa  87.4  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  29.13 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  30 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  31.43 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  21.04 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  20 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  30.54 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  21.68 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  21.68 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  21.68 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  21.17 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  28.83 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  20.92 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  27.1 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  24.47 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  27.94 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  20.92 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  28.17 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  28.17 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  20.92 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  28.35 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  25.97 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.35 
 
 		 469 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  28.19 
 
 		 460 aa  67  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  24.1 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  19.78 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  28.95 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  28.34 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  28.51 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.25 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  27.35 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  26.85 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.42 
 
 		 639 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  25.33 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.56 
 
 		 463 aa  54.3  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  25.82 
 
 		 509 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  28.45 
 
 		 465 aa  53.5  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.79 
 
 		 642 aa  53.5  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  44.44 
 
 		 571 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  22.54 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  40.37 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  23.54 
 
 		 495 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  27.8 
 
 		 467 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  39.24 
 
 		 938 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  58.97 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  45.16 
 
 		 598 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  24.35 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  44.87 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  44.87 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  58.97 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  58.7 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  25.68 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>