More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1875 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 		 639 aa  1315    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  71.61 
 
 		 640 aa  941    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  61.41 
 
 		 639 aa  823    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.87 
 
 		 643 aa  832    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.92 
 
 		 642 aa  805    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.22 
 
 		 644 aa  782    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.27 
 
 		 647 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.63 
 
 		 647 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  31.55 
 
 		 647 aa  342  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  31.85 
 
 		 645 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  31.75 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  38.25 
 
 		 811 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  36.55 
 
 		 481 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  38.2 
 
 		 511 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  39.34 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  37.21 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  37.56 
 
 		 506 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  37.56 
 
 		 506 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  36.04 
 
 		 523 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  36.62 
 
 		 482 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  38 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  35.74 
 
 		 546 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  33.09 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  36.28 
 
 		 551 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  31.25 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.58 
 
 		 139 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.17 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  29.78 
 
 		 479 aa  76.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  28.14 
 
 		 500 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  30.91 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  27.19 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  41.67 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  31.05 
 
 		 486 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  28.57 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.33 
 
 		 148 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  25.17 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  28.3 
 
 		 482 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  29.46 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  27.84 
 
 		 543 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  30.18 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  28.44 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  29.65 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  29.65 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  27.43 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  45.9 
 
 		 63 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  43.06 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  27.91 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  26.82 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  27.4 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.75 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  27.88 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  27.4 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  27.18 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  28.9 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  25.22 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  29.73 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  26.91 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  27.06 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  37.33 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  24.35 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.48 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  36 
 
 		 182 aa  62  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.15 
 
 		 141 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  32.29 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  27 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  25.87 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  36.62 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  38.81 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  47.17 
 
 		 592 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  26.36 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  27.05 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  25.52 
 
 		 475 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.32 
 
 		 478 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54051  pds-like2, phytoene desaturase-like protein  30.74 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.250882  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  26.7 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43187  predicted protein  30.74 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  41.77 
 
 		 149 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  26.32 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 		 130 aa  58.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  24.05 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.89 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.78 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.78 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.31 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.38 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.25 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.52 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  26.97 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.32 
 
 		 130 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  34.67 
 
 		 181 aa  57  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  33.33 
 
 		 182 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 		 508 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 		 128 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.48 
 
 		 463 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 338 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  22.68 
 
 		 989 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.41 
 
 		 178 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>