More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38345 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  71.45 
 
 
624 aa  842    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  61.41 
 
 
552 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  100 
 
 
599 aa  1234    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  58.71 
 
 
471 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  57.6 
 
 
474 aa  559  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  55.93 
 
 
479 aa  555  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  56.99 
 
 
475 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  58.84 
 
 
466 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  56.12 
 
 
472 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  56.34 
 
 
475 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  57.11 
 
 
464 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  58.49 
 
 
465 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  56.9 
 
 
462 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  57.73 
 
 
473 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  57.11 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  57.11 
 
 
459 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  58.41 
 
 
466 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  56.2 
 
 
472 aa  537  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  55.72 
 
 
472 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  54.26 
 
 
479 aa  534  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  54.62 
 
 
477 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  52.05 
 
 
589 aa  501  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  39.4 
 
 
463 aa  336  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  36.54 
 
 
453 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  36.25 
 
 
453 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  36.32 
 
 
453 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  34.62 
 
 
455 aa  300  6e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  35.47 
 
 
453 aa  296  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  36.31 
 
 
453 aa  296  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  34.82 
 
 
453 aa  294  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  33.89 
 
 
462 aa  263  8.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  32.29 
 
 
461 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  32.83 
 
 
461 aa  259  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  32.99 
 
 
460 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  32.74 
 
 
462 aa  258  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  31.59 
 
 
460 aa  257  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  31.95 
 
 
459 aa  253  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  32.46 
 
 
489 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  33.67 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  32.4 
 
 
483 aa  245  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  33.06 
 
 
479 aa  243  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  31.46 
 
 
490 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  31.46 
 
 
490 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  33.99 
 
 
488 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  33.2 
 
 
488 aa  241  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 
478 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  33 
 
 
486 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  32.12 
 
 
479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  31.43 
 
 
484 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  32.04 
 
 
484 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  31.22 
 
 
484 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  32.39 
 
 
486 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  31.05 
 
 
499 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  32.6 
 
 
490 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  32.65 
 
 
481 aa  220  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  28.96 
 
 
591 aa  203  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.21 
 
 
503 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  25.11 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.05 
 
 
500 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  28.19 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.53 
 
 
520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.22 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.3 
 
 
447 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  22.52 
 
 
448 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  22.1 
 
 
452 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  22.1 
 
 
452 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  22.1 
 
 
452 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.27 
 
 
439 aa  94  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  22.84 
 
 
562 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.03 
 
 
432 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  26.41 
 
 
645 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  30.63 
 
 
647 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  24.95 
 
 
506 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  24.95 
 
 
506 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  29.1 
 
 
647 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.23 
 
 
506 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  22.16 
 
 
569 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.11 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.09 
 
 
647 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  22.72 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  23.57 
 
 
544 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  22.38 
 
 
506 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  24.21 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  26.13 
 
 
427 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  26.18 
 
 
428 aa  65.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  31.75 
 
 
396 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  25.97 
 
 
436 aa  64.7  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  22.31 
 
 
543 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  23.06 
 
 
543 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  26.3 
 
 
427 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.52 
 
 
424 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  23.19 
 
 
551 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  25.49 
 
 
435 aa  63.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  30.71 
 
 
396 aa  62.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  23.77 
 
 
523 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  43.24 
 
 
438 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  22.55 
 
 
511 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  21.37 
 
 
486 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.81 
 
 
640 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  24.52 
 
 
503 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>