More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4135 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  100 
 
 		 451 aa  895    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  27.37 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  26.99 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.97 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  27.09 
 
 		 479 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  26.61 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  26.97 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  25.76 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  25.28 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  26.22 
 
 		 453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  25.55 
 
 		 462 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.65 
 
 		 474 aa  162  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.71 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  26.42 
 
 		 472 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  25.61 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  25.39 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  25.89 
 
 		 453 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.83 
 
 		 472 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.94 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  26.68 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  25.62 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  25.62 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  25.11 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  25.77 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  26.48 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  28.1 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  26.88 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  26.97 
 
 		 589 aa  152  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  26.24 
 
 		 479 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  24.67 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  26.46 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  24.79 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  26.81 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  25.33 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  26.94 
 
 		 552 aa  149  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  27.17 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  26.86 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  26.53 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.73 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  25.11 
 
 		 599 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  26.41 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  25.85 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  24.36 
 
 		 624 aa  140  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  27.15 
 
 		 462 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  24.34 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  24.83 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  22.78 
 
 		 499 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  24.03 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  25 
 
 		 486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  23.91 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  21.56 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  24.84 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  21.56 
 
 		 484 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  23.53 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  22.97 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  25.31 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  22.81 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.29 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  26.09 
 
 		 500 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  25.69 
 
 		 481 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  27.71 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.09 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  23.57 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  26.86 
 
 		 811 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.98 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  26.72 
 
 		 647 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  26.72 
 
 		 647 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  24.36 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  28.4 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.15 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  27.23 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  24.55 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  24.61 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.77 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  26.07 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  27 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  27 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.13 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  28.63 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  24.33 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  25.33 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.43 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.43 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  27.22 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.43 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  23.08 
 
 		 645 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  27.99 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  26.68 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  25.71 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  24.27 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  27.65 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.77 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.59 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  26.11 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  24.55 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  24.55 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.87 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  25.85 
 
 		 569 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  23.61 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  25.9 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>