158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0282 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  88.74 
 
 		 508 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  100 
 
 		 508 aa  1004    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  45.24 
 
 		 811 aa  350  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  43.89 
 
 		 523 aa  332  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  43.9 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  43.04 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  43.04 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  42.43 
 
 		 546 aa  309  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  42.51 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  42.01 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  41.28 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  41.15 
 
 		 482 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  41.67 
 
 		 551 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  40.41 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  37.12 
 
 		 639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.89 
 
 		 642 aa  140  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.92 
 
 		 640 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.43 
 
 		 639 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.42 
 
 		 643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  31.03 
 
 		 647 aa  130  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  33.18 
 
 		 648 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.36 
 
 		 647 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.36 
 
 		 647 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  34.56 
 
 		 645 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.63 
 
 		 644 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  26.22 
 
 		 500 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  24.54 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.85 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  27.35 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  28.17 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  23.59 
 
 		 599 aa  67.8  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.97 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.73 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  25.05 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  42.03 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  22.07 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.06 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  38.57 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  38.57 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  39.13 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  43.48 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  36.23 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  41.43 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  39.13 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  25.25 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  43.48 
 
 		 591 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  24.65 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  40.58 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  36.23 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  22.31 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  28.74 
 
 		 589 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  36.23 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  27.02 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  22.8 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.79 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  23.71 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  22.63 
 
 		 460 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.39 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.63 
 
 		 466 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.11 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  36.23 
 
 		 484 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  36.23 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.04 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.34 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  27.15 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  27.15 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  27.15 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  35.71 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.65 
 
 		 465 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  34.25 
 
 		 453 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  32.88 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  23.24 
 
 		 543 aa  50.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  32.47 
 
 		 453 aa  50.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  31.51 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2662  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  48.89 
 
 		 658 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  51.06 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  32.86 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.29 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.3 
 
 		 565 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  37.78 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.08 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  35.21 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  32.67 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1838  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.45 
 
 		 671 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  26.57 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  45.9 
 
 		 565 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  49.09 
 
 		 511 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 543 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0330  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 540 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.61 
 
 		 462 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  31.51 
 
 		 453 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  45.45 
 
 		 792 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.72 
 
 		 496 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.87 
 
 		 472 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.61 
 
 		 464 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  26.88 
 
 		 440 aa  47  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  33.33 
 
 		 396 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  24.13 
 
 		 520 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.75 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>