170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0241 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  100 
 
 		 508 aa  1015    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  88.74 
 
 		 508 aa  833    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  44.18 
 
 		 811 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  42.36 
 
 		 523 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  41.86 
 
 		 506 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  42.11 
 
 		 520 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  40.82 
 
 		 506 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  40.82 
 
 		 506 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  40.94 
 
 		 546 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  41.59 
 
 		 482 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  41.23 
 
 		 551 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  39.25 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  39.82 
 
 		 481 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  40.88 
 
 		 519 aa  281  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  33.55 
 
 		 639 aa  148  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.17 
 
 		 642 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  32.55 
 
 		 647 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.09 
 
 		 639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.57 
 
 		 640 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  32.28 
 
 		 647 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  32.28 
 
 		 647 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.66 
 
 		 643 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  31.35 
 
 		 645 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  32.16 
 
 		 648 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.45 
 
 		 644 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  26.09 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  24.27 
 
 		 503 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  27.6 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  24.25 
 
 		 552 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  28.49 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  23.64 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.54 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.39 
 
 		 520 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.78 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.05 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  30.58 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  24 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  32.23 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  44.93 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  23.82 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  42.86 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  38.57 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  38.57 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  38.57 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  23.17 
 
 		 624 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  25.15 
 
 		 589 aa  57  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  36.23 
 
 		 479 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.64 
 
 		 471 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  22.71 
 
 		 599 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  22.2 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  37.68 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  32.91 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  37.14 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  23.96 
 
 		 479 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  37.68 
 
 		 484 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.85 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  22.99 
 
 		 578 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.93 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  37.14 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  24.78 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.41 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  21.81 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  21.99 
 
 		 455 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.67 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  22.2 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.33 
 
 		 472 aa  50.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.73 
 
 		 466 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  23.99 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.48 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  26.42 
 
 		 423 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  28.33 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.55 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  27.12 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  21.63 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  31.51 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  27.12 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.02 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  27.12 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  32.86 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  27.69 
 
 		 565 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.85 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  21.81 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2662  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  47.73 
 
 		 658 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  23.22 
 
 		 462 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  26.54 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  35.71 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  34.57 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  50 
 
 		 552 aa  47.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  23.01 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  53.06 
 
 		 474 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.18 
 
 		 496 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  44.44 
 
 		 792 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.27 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  34.78 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  36.84 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  31.94 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.82 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>