207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4188 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  72.2 
 
 
475 aa  706    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  79.96 
 
 
479 aa  778    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  69.1 
 
 
479 aa  690    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  100 
 
 
477 aa  975    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  67.33 
 
 
472 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  67.11 
 
 
472 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  70.11 
 
 
474 aa  682    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  71.08 
 
 
459 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  67.69 
 
 
472 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  70.5 
 
 
471 aa  712    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  72.41 
 
 
475 aa  706    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  65.34 
 
 
462 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  65.12 
 
 
464 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  65.34 
 
 
472 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  63.36 
 
 
465 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  62.74 
 
 
473 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  64.02 
 
 
466 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  63.8 
 
 
466 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  54.62 
 
 
599 aa  524  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  53.32 
 
 
624 aa  519  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  53.81 
 
 
589 aa  515  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  53.03 
 
 
552 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  38.65 
 
 
453 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  40.35 
 
 
463 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  37.28 
 
 
453 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  38.6 
 
 
453 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  36.84 
 
 
453 aa  317  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  37.39 
 
 
453 aa  317  3e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  37.61 
 
 
455 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  36.66 
 
 
453 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  37.5 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  37.95 
 
 
461 aa  302  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  37.78 
 
 
459 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  36.88 
 
 
461 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  36.04 
 
 
462 aa  289  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  36.57 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  36.79 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  36.78 
 
 
483 aa  270  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  34.93 
 
 
484 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  34.93 
 
 
484 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  33.74 
 
 
489 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  35.22 
 
 
484 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  34.8 
 
 
499 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  33.4 
 
 
490 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  33.4 
 
 
490 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  33.27 
 
 
486 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  33.47 
 
 
478 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  35.52 
 
 
488 aa  249  7e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  34.85 
 
 
488 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  33.68 
 
 
479 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  34.3 
 
 
482 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  33.75 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  33.54 
 
 
486 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  35.52 
 
 
490 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  35.42 
 
 
481 aa  232  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  32.53 
 
 
591 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  28.17 
 
 
451 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.42 
 
 
503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  28.94 
 
 
481 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.84 
 
 
520 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.39 
 
 
477 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.38 
 
 
439 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.94 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  25.62 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  25.62 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  25.62 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  25.68 
 
 
448 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  24.26 
 
 
486 aa  87.8  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  25.37 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  25.66 
 
 
562 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  23.79 
 
 
544 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  23.87 
 
 
569 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  28.71 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  25.76 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  26.22 
 
 
647 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.57 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.15 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  27.41 
 
 
647 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  27.41 
 
 
647 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.82 
 
 
440 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  29.7 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.1 
 
 
506 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  32.81 
 
 
645 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  24.04 
 
 
427 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  25.47 
 
 
428 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  23.89 
 
 
506 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  23.89 
 
 
506 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  24.94 
 
 
543 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  25.82 
 
 
428 aa  60.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  28.66 
 
 
436 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  22.65 
 
 
578 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  25.82 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.74 
 
 
437 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  31.08 
 
 
432 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  23.9 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.89 
 
 
639 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
399 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.23 
 
 
432 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  26.4 
 
 
523 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>