268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1605 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  100 
 
 		 426 aa  860    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  37.7 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  38.55 
 
 		 407 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  36.79 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  35.31 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  39.48 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  34.71 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  35.43 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  35.78 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  34.02 
 
 		 425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  33.18 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  33.7 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  37.35 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  35.89 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  34.66 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  33.18 
 
 		 420 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  34.11 
 
 		 427 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  37.03 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  34.25 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  37.05 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  31.57 
 
 		 433 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  32.26 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  31.87 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  34.1 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  34.08 
 
 		 446 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  34.47 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  34.64 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  33.42 
 
 		 418 aa  123  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  30.96 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.92 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  25.4 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.07 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  24.4 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  29.92 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  28.62 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1008  putative protoporphyrinogen oxidase  28.62 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961775  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  29.75 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  35.04 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  28.62 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  28.62 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  28.62 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  28.62 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  46.43 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  31.87 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  29.78 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  47.06 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  33.96 
 
 		 496 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  46.58 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  52.94 
 
 		 479 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  48.28 
 
 		 525 aa  53.1  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  45.1 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  32.63 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  28.46 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  32.63 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  41.67 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  27.32 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  34.48 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  47.06 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  26.97 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  41.77 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  38.18 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  25.55 
 
 		 510 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  41.82 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  34.48 
 
 		 355 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  49.02 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 469 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50.94 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  48.33 
 
 		 506 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  27.46 
 
 		 488 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  41.82 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 554 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  57.45 
 
 		 545 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  36.78 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  37.04 
 
 		 487 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  40 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  49.09 
 
 		 463 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  24.54 
 
 		 492 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  28.09 
 
 		 476 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  29.92 
 
 		 566 aa  49.7  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  52.83 
 
 		 463 aa  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  26.71 
 
 		 447 aa  49.7  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  42.86 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  51.02 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  48 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0283  putative oxidoreductase  28.62 
 
 		 1309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  37.84 
 
 		 599 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  28 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.07 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  37.78 
 
 		 548 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  28 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  51.85 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>