158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0283 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1008  putative protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
432 aa  844    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961775  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0283  putative oxidoreductase  100 
 
 
1309 aa  2432    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
432 aa  844    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  100 
 
 
432 aa  844    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  100 
 
 
432 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
432 aa  844    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  26.15 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  29.29 
 
 
475 aa  70.1  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  31.45 
 
 
456 aa  70.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  29.45 
 
 
488 aa  66.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  21.44 
 
 
466 aa  65.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  25.87 
 
 
461 aa  64.3  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.37 
 
 
469 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  29.86 
 
 
471 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  28.41 
 
 
433 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  27.59 
 
 
474 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  29.93 
 
 
420 aa  62.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  22.41 
 
 
473 aa  61.6  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  29.77 
 
 
482 aa  60.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  25.23 
 
 
447 aa  60.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  36.63 
 
 
482 aa  59.3  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  26.8 
 
 
470 aa  59.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  45.95 
 
 
451 aa  59.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  23.09 
 
 
473 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  21.71 
 
 
466 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  28.25 
 
 
426 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26.88 
 
 
492 aa  57  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  22.87 
 
 
466 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  25.97 
 
 
466 aa  56.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  25.97 
 
 
466 aa  56.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.46 
 
 
647 aa  56.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  39.47 
 
 
349 aa  55.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  27.14 
 
 
467 aa  55.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  24.72 
 
 
466 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  24.72 
 
 
466 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  24.72 
 
 
466 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  24.29 
 
 
482 aa  53.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  21.62 
 
 
466 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  26.04 
 
 
436 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  25.14 
 
 
466 aa  53.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  30.31 
 
 
394 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  29.82 
 
 
465 aa  53.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  32 
 
 
410 aa  53.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  26.63 
 
 
468 aa  53.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  32.6 
 
 
470 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  24.72 
 
 
466 aa  52.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  50 
 
 
436 aa  52.8  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  24.55 
 
 
429 aa  52.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  35.96 
 
 
464 aa  52.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  39.56 
 
 
438 aa  52.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  32.56 
 
 
463 aa  51.6  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  28.07 
 
 
490 aa  51.6  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  30.36 
 
 
444 aa  51.6  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  52.5 
 
 
491 aa  51.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  26.49 
 
 
639 aa  51.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  46.27 
 
 
425 aa  51.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  36.62 
 
 
353 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  33.64 
 
 
424 aa  50.4  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  23.73 
 
 
463 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  29.95 
 
 
421 aa  50.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 
473 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  25.28 
 
 
436 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  23.53 
 
 
647 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  31.11 
 
 
470 aa  50.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  26.97 
 
 
495 aa  50.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  32.28 
 
 
407 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  27.85 
 
 
459 aa  50.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  23.53 
 
 
647 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 
463 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  30.08 
 
 
510 aa  50.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  25.67 
 
 
645 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  40.54 
 
 
575 aa  49.7  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  40 
 
 
438 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  27.12 
 
 
469 aa  49.7  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  37.14 
 
 
350 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  27.64 
 
 
456 aa  49.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  26.64 
 
 
470 aa  49.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3504  D-amino-acid dehydrogenase  63.33 
 
 
438 aa  49.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  23.39 
 
 
436 aa  49.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0309  D-amino-acid dehydrogenase  63.33 
 
 
430 aa  49.3  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  26.41 
 
 
495 aa  49.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  24.28 
 
 
509 aa  49.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  41.56 
 
 
493 aa  49.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  24.38 
 
 
472 aa  49.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  49.09 
 
 
462 aa  49.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  41.56 
 
 
493 aa  49.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  29.28 
 
 
460 aa  49.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  25.67 
 
 
473 aa  48.9  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  51.28 
 
 
573 aa  48.9  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  41.56 
 
 
493 aa  48.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  48.89 
 
 
478 aa  48.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  53.66 
 
 
532 aa  48.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  36.36 
 
 
438 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  34.06 
 
 
410 aa  48.5  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  43.28 
 
 
428 aa  48.5  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  50 
 
 
562 aa  48.5  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  25.28 
 
 
436 aa  48.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  47.27 
 
 
463 aa  47.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  45.9 
 
 
448 aa  48.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  38.2 
 
 
565 aa  48.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>