187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0581 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  100 
 
 		 413 aa  770    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  29.4 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  32.94 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  30.36 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  35.41 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  29.52 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  27.19 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  31.75 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  33.25 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  31.83 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  28.77 
 
 		 437 aa  93.2  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  33.96 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  34.23 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  31.59 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  30.07 
 
 		 425 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  32.85 
 
 		 413 aa  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  31.44 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  29.89 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  30.07 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  27.73 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  29.26 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  29.8 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  32.05 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  31.84 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  46.08 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  42.86 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  25.62 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  24.71 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  29.87 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  34.19 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  23.16 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  23.32 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  23.16 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.43 
 
 		 639 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  25.06 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  24.61 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  24.03 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  42.25 
 
 		 469 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  28.9 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  46.97 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  41.89 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  26.84 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  50 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  25.57 
 
 		 645 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  23.66 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  24.95 
 
 		 492 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  29.38 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 523 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  43.28 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 547 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 528 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  42.25 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.35 
 
 		 643 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  43.28 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  44.29 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  50 
 
 		 460 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  32.76 
 
 		 509 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  45.45 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 		 515 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  27.05 
 
 		 522 aa  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  43.28 
 
 		 468 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  37.5 
 
 		 359 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  40.62 
 
 		 496 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.64 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  45.68 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  45.68 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  36.99 
 
 		 599 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  30.82 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  43.01 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  26.42 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  56.86 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.38 
 
 		 527 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  43.28 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 		 547 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  24.63 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  31.13 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 551 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  44.78 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  24.14 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  44.78 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  44.78 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  52 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.78 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  32.76 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  50.91 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  41.67 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  44.78 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  41.67 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.71 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  41.67 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.78 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  50.91 
 
 		 515 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  24.73 
 
 		 503 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  41.51 
 
 		 495 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  41.51 
 
 		 495 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 346 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  23.78 
 
 		 516 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>