More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2885 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  100 
 
 
418 aa  818    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  60.94 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  55.41 
 
 
455 aa  437  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  57.21 
 
 
437 aa  432  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  56.85 
 
 
446 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  42.17 
 
 
427 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  41.15 
 
 
420 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  40.52 
 
 
425 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  40.52 
 
 
428 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  41.53 
 
 
410 aa  242  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  35.21 
 
 
468 aa  210  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  34.61 
 
 
470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  35.71 
 
 
426 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  37.09 
 
 
436 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  31.68 
 
 
438 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  36.51 
 
 
423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  36.15 
 
 
407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  37.59 
 
 
414 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  34.76 
 
 
433 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  34.88 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  33.1 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  34.35 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  32.01 
 
 
448 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  34.67 
 
 
394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  33.41 
 
 
413 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  30.93 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  27.65 
 
 
433 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  31.5 
 
 
418 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  31.96 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  26.71 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  24.27 
 
 
425 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  26.12 
 
 
501 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  25.54 
 
 
589 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  48.21 
 
 
468 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  46.43 
 
 
468 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  25.87 
 
 
467 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.19 
 
 
464 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  46.43 
 
 
468 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
530 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
530 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  31.21 
 
 
421 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
530 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  31.84 
 
 
419 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  50 
 
 
519 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  29.27 
 
 
460 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  41.67 
 
 
552 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  39.6 
 
 
543 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  30.82 
 
 
492 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  25.1 
 
 
488 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  36.8 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5081  glucose-inhibited division protein A  57.89 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.880262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  36.8 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  23.52 
 
 
484 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
518 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.87 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  24.75 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  40.32 
 
 
645 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  46.15 
 
 
502 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  44.19 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.05 
 
 
478 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  46.15 
 
 
502 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  30.14 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
547 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  40.3 
 
 
537 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  45.1 
 
 
484 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  23.96 
 
 
425 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
557 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
513 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  27.59 
 
 
489 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  49.12 
 
 
463 aa  53.5  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  41.82 
 
 
245 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  24.85 
 
 
488 aa  53.1  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
420 aa  53.1  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  41.07 
 
 
485 aa  53.1  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  50.88 
 
 
463 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  38.71 
 
 
599 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  50 
 
 
437 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  40 
 
 
488 aa  53.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  45.1 
 
 
476 aa  53.1  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  37.1 
 
 
647 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  37.19 
 
 
472 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  23.23 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  23.23 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  35.21 
 
 
624 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  22.57 
 
 
484 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
505 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  39.19 
 
 
465 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  44.29 
 
 
421 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  22.57 
 
 
484 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  27.65 
 
 
525 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  32.1 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  49.12 
 
 
462 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
534 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  30.68 
 
 
392 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  34.78 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  40.82 
 
 
470 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  29.45 
 
 
474 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  30.77 
 
 
506 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  30.77 
 
 
506 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>