189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3414 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  100 
 
 		 425 aa  863    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  59.39 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1034  hypothetical protein  37.87 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1760  hypothetical protein  39.51 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0921  hypothetical protein  39.71 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1023  hypothetical protein  39.36 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0953  hypothetical protein  38.18 
 
 		 399 aa  205  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.46 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 502 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 515 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  26.23 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.53 
 
 		 507 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  25.39 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  26.13 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.59 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.59 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  23.76 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.21 
 
 		 598 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25 
 
 		 511 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.14 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  25.84 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.87 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  25.91 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.87 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  23.77 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  25.79 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  25.77 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.27 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  25.3 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  24.44 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  23.91 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  22.59 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23.48 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  25.13 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24.51 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 722 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  22.86 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  24.49 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  26.37 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  23.68 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  22.43 
 
 		 509 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  24.18 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  23.21 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  25.31 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  22.4 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  25.91 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  23.91 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  24.61 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  23.22 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  23.97 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  28.08 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  23.3 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  28.08 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  25.24 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.86 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  22.75 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  23.89 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  21.39 
 
 		 493 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  22.65 
 
 		 437 aa  57  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  23.6 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  23 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.56 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  23.84 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  25.82 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 514 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  21.95 
 
 		 938 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 547 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 533 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 717 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  28.5 
 
 		 708 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.96 
 
 		 544 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  23.94 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.43 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.58 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  24.34 
 
 		 595 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  23.86 
 
 		 542 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  26.79 
 
 		 586 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.85 
 
 		 511 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  24.7 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  23.51 
 
 		 556 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  36 
 
 		 499 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  36 
 
 		 499 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  23.26 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  23.89 
 
 		 508 aa  50.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  23.27 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  24.08 
 
 		 475 aa  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  34.67 
 
 		 517 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>