148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1363 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 420 aa  847    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  44.18 
 
 		 421 aa  338  8e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 539 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 547 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 555 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  21.25 
 
 		 533 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  21.76 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  21.46 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 533 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  23.29 
 
 		 556 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 535 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 530 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 520 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 		 527 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 523 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  38.55 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  23.31 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.84 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  39.77 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  39.77 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  24.75 
 
 		 530 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  62.22 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 554 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 521 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  23.73 
 
 		 536 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  22.53 
 
 		 505 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  22.46 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 		 547 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 516 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2408  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 563 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410244  normal  0.0736984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  46.3 
 
 		 556 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 531 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.86 
 
 		 520 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 517 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  46.3 
 
 		 561 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  27.05 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  24.33 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  23.84 
 
 		 535 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  21.87 
 
 		 522 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.21 
 
 		 501 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 528 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  27.86 
 
 		 520 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2363  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.55 
 
 		 432 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28713  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  26.37 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  25.44 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 		 514 aa  49.7  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  26.37 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  21.58 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1347  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.37 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.15982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.93 
 
 		 511 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  23.79 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  24.3 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  32.63 
 
 		 516 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  22.65 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  37.5 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 557 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 547 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  43.48 
 
 		 510 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 547 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  48.98 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  23.62 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  24.83 
 
 		 502 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  48.98 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>