153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3795 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  100 
 
 
413 aa  796    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  88.38 
 
 
413 aa  625  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  49.88 
 
 
407 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  46.98 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  46.24 
 
 
418 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  36.67 
 
 
438 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  41.86 
 
 
433 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  36.32 
 
 
468 aa  230  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  43.1 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  41.01 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  37.47 
 
 
433 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  34.18 
 
 
470 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  39.76 
 
 
418 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  40.38 
 
 
415 aa  196  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  37.26 
 
 
426 aa  196  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  36.36 
 
 
451 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  35.17 
 
 
410 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  37.38 
 
 
436 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  34.43 
 
 
425 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  37.14 
 
 
448 aa  176  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  35.66 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  33.03 
 
 
437 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  33.73 
 
 
428 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  33.57 
 
 
427 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  33.17 
 
 
431 aa  152  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  31.57 
 
 
455 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  30.17 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  32.21 
 
 
446 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  33.42 
 
 
413 aa  96.7  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 
469 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  27.24 
 
 
473 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  27.42 
 
 
473 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  31.87 
 
 
473 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  26.76 
 
 
473 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  25.52 
 
 
473 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  46.05 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  27.18 
 
 
473 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.88 
 
 
464 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  24.29 
 
 
467 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 
473 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 
473 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 
473 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  51.72 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  30.65 
 
 
488 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  26.04 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  50 
 
 
949 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  32.76 
 
 
442 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  22.6 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  55.56 
 
 
464 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.46 
 
 
454 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.33 
 
 
640 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  29.25 
 
 
645 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  30.83 
 
 
452 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  30.83 
 
 
452 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  30.83 
 
 
452 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  40.26 
 
 
456 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  43.59 
 
 
447 aa  50.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  49.06 
 
 
537 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  55.81 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  56 
 
 
445 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  41.18 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  42.11 
 
 
548 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  47.06 
 
 
495 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  47.06 
 
 
495 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  59.52 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  33.77 
 
 
647 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  49.06 
 
 
519 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  39.73 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  43.28 
 
 
599 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  48.28 
 
 
463 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  29.82 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  40.26 
 
 
436 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  40.26 
 
 
436 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  27.17 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  32.8 
 
 
448 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  33.09 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  41.89 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  41.89 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 
490 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  28.43 
 
 
456 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  41.89 
 
 
436 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  44.12 
 
 
589 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  38.96 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  41.1 
 
 
436 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  41.33 
 
 
367 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  46.43 
 
 
479 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  35.63 
 
 
542 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  50 
 
 
463 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  40.79 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  42 
 
 
445 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  43.94 
 
 
461 aa  46.6  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  30.46 
 
 
456 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  42.31 
 
 
444 aa  46.6  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  48.89 
 
 
352 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  37.66 
 
 
436 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  43.75 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  30.03 
 
 
460 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  49.02 
 
 
479 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  25.75 
 
 
493 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>