More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4664 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  100 
 
 		 418 aa  800    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  46.23 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  48.19 
 
 		 413 aa  266  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  46.8 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  47.71 
 
 		 413 aa  259  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  43.78 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  40.87 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  39.35 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  42.89 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  34.5 
 
 		 468 aa  199  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  34.64 
 
 		 438 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  40.15 
 
 		 418 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  39.13 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  31.66 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  37.44 
 
 		 448 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  34.13 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  34.87 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  34.48 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  35.64 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  34.2 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  33.77 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  32.11 
 
 		 428 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  33.7 
 
 		 437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  32.55 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  34.57 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  32.79 
 
 		 420 aa  140  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  34.09 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  31.39 
 
 		 431 aa  126  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  34.65 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  25.1 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  30.54 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  31.52 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  29.64 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  54.9 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  22.71 
 
 		 473 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  28.74 
 
 		 436 aa  57  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  34.05 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  22.38 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  22.58 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  28.49 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  27.12 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  31.25 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  26.05 
 
 		 493 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  30.29 
 
 		 472 aa  53.5  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  22.57 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  32.42 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  23.61 
 
 		 473 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  22.5 
 
 		 473 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  22.5 
 
 		 473 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  22.5 
 
 		 473 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  22.5 
 
 		 473 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  28.38 
 
 		 447 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 		 493 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  32.18 
 
 		 491 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  51.92 
 
 		 491 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  25.64 
 
 		 493 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  25.64 
 
 		 493 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  52.54 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  28.77 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  47.92 
 
 		 502 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  25.91 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  23.28 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  47.92 
 
 		 502 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  44.44 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  44 
 
 		 537 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  25.68 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  54.24 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  36.46 
 
 		 552 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  26.53 
 
 		 505 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  53.06 
 
 		 498 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  51.79 
 
 		 462 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  47.92 
 
 		 501 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 		 580 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  62.79 
 
 		 499 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  43.94 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  44.44 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  46.81 
 
 		 573 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  41.67 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  29.84 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  43.24 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  32.57 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  32.02 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  34.39 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  50 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  40.24 
 
 		 508 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.27 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  47.37 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  46.97 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  48.98 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  45.28 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  27.49 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  35.94 
 
 		 645 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.62 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  38.14 
 
 		 548 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  37.04 
 
 		 499 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  24.32 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  47.06 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  52 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>