155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0805 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  100 
 
 		 437 aa  859    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  46.38 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  43.28 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 		 468 aa  309  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.9 
 
 		 469 aa  280  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  41.88 
 
 		 472 aa  280  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  39.61 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 		 481 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 		 474 aa  269  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.22 
 
 		 477 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 506 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.12 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 		 484 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 		 477 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  36.81 
 
 		 476 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.11 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 478 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 476 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  39.33 
 
 		 503 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  38.91 
 
 		 515 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 		 487 aa  247  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 		 491 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  40.13 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  37.72 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  38.09 
 
 		 479 aa  240  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  38.41 
 
 		 476 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  38.41 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  38.41 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  39.87 
 
 		 505 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  38.66 
 
 		 496 aa  236  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  39.27 
 
 		 484 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  37.37 
 
 		 480 aa  216  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  36.11 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  36.67 
 
 		 482 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  32.04 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  46.04 
 
 		 568 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 474 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 524 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 560 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 530 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 530 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 534 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.82 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 534 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 528 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.14 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  31.15 
 
 		 530 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 531 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 531 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 580 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.67 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  25.47 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 559 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 534 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 		 545 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 537 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  29.48 
 
 		 532 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  46.48 
 
 		 522 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  29.48 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 555 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 551 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 547 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 532 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 552 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 524 aa  53.9  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 535 aa  53.1  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.64 
 
 		 533 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 523 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  43.59 
 
 		 456 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  24.6 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  50 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  47.92 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  36.63 
 
 		 527 aa  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 536 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  45.83 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 523 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 536 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  39.53 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 532 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>