180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0553 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 472 aa  944    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  51.83 
 
 		 487 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  48.93 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  49.25 
 
 		 474 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  47 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  45.86 
 
 		 477 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  47.03 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  47.23 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  47.1 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  42.4 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  48.72 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  43.47 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  44.97 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  46.37 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  44.23 
 
 		 473 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  45.13 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  47.65 
 
 		 505 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 468 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  43.5 
 
 		 481 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  49.15 
 
 		 474 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  50.32 
 
 		 474 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  49.89 
 
 		 474 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  41.44 
 
 		 479 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 		 466 aa  340  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  42.77 
 
 		 484 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 		 487 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  40.08 
 
 		 482 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.67 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  43.43 
 
 		 491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  39.46 
 
 		 503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 		 524 aa  312  6.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.36 
 
 		 511 aa  309  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  38.54 
 
 		 496 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.25 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  38.57 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  38.56 
 
 		 491 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  37.97 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  37.89 
 
 		 491 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  37.89 
 
 		 491 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  37.97 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  37.68 
 
 		 476 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  38.14 
 
 		 480 aa  272  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 531 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  36.09 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 568 aa  211  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 526 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.65 
 
 		 545 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 534 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 530 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 528 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 534 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 528 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 580 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  31.93 
 
 		 530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  28.21 
 
 		 535 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 523 aa  147  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 533 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 531 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.77 
 
 		 539 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 523 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 547 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 537 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  26.03 
 
 		 533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 536 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 556 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 561 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 563 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 565 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 		 564 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.63 
 
 		 510 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 524 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 		 555 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 534 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  26.79 
 
 		 527 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 514 aa  94  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 554 aa  93.6  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 554 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  23.72 
 
 		 556 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 536 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 552 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  31.66 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 547 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  26.22 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>