150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11461 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  100 
 
 
473 aa  949    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  59.02 
 
 
466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  56.72 
 
 
468 aa  554  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  57.2 
 
 
477 aa  481  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 
476 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 
477 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 
484 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  47.76 
 
 
474 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  47.55 
 
 
474 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  50.97 
 
 
487 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  45.84 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  47.32 
 
 
470 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 
506 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  45.94 
 
 
478 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  46.12 
 
 
472 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  45.04 
 
 
465 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  45.89 
 
 
481 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  48.08 
 
 
505 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  40.86 
 
 
476 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  45.72 
 
 
503 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 
472 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.12 
 
 
469 aa  365  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.83 
 
 
511 aa  363  4e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 
484 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  46.51 
 
 
515 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  42.95 
 
 
479 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  43.8 
 
 
487 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.26 
 
 
499 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  43.22 
 
 
496 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  42.24 
 
 
480 aa  335  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 
469 aa  334  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  42.89 
 
 
482 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  47.96 
 
 
474 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  46.47 
 
 
474 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  48.6 
 
 
474 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 
491 aa  328  9e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  41.16 
 
 
491 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  41.16 
 
 
491 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  41.16 
 
 
476 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  41.81 
 
 
482 aa  326  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 
491 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  41.67 
 
 
482 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  43.28 
 
 
437 aa  302  7.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 
524 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
531 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  46.62 
 
 
568 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
560 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
530 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
530 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 
534 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.13 
 
 
545 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
534 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
526 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 
580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  33.26 
 
 
530 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 
528 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
523 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.38 
 
 
535 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
533 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
531 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
523 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
528 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
531 aa  106  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
510 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 
522 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
523 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
547 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 
563 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
549 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
514 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
530 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
554 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 
554 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 
565 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  23.51 
 
 
556 aa  86.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 
556 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.43 
 
 
510 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.14 
 
 
548 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 
559 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  21.06 
 
 
564 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  24.22 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 
561 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  24.44 
 
 
533 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 
539 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
551 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
536 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  24.27 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
552 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
545 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 
555 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 
518 aa  66.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 
537 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
536 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
536 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  25.86 
 
 
510 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
533 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>