More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0342 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
531 aa  1048    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  56.3 
 
 
545 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  56.53 
 
 
534 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  54.39 
 
 
530 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  52.73 
 
 
530 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  52.73 
 
 
530 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  56.91 
 
 
534 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  56.72 
 
 
530 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  55.35 
 
 
580 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  49.1 
 
 
560 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  50.2 
 
 
526 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  51.52 
 
 
528 aa  438  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  49.41 
 
 
528 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  47.09 
 
 
524 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  37.48 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 
474 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  36.44 
 
 
474 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 
487 aa  263  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  37.13 
 
 
472 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 
506 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  36.4 
 
 
465 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 
515 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
523 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
481 aa  243  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
477 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 
466 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  33.2 
 
 
476 aa  237  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 
505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  35.17 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  40.83 
 
 
474 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
478 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 
476 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  31.35 
 
 
476 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 
468 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 
469 aa  229  8e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
472 aa  228  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 
474 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.7 
 
 
503 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.95 
 
 
469 aa  207  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  35.63 
 
 
479 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
487 aa  201  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
484 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
491 aa  197  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  32.36 
 
 
496 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  36.53 
 
 
511 aa  192  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
559 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  31.75 
 
 
535 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 
528 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
554 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  33.72 
 
 
480 aa  187  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
524 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
554 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
556 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
531 aa  177  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
533 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.27 
 
 
499 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  33.4 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
564 aa  169  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  32.09 
 
 
482 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
547 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
510 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
561 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  30.31 
 
 
476 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
522 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  30.31 
 
 
491 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  30.31 
 
 
491 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  30.14 
 
 
482 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.34 
 
 
529 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.74 
 
 
527 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  30.12 
 
 
510 aa  147  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
534 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  28.22 
 
 
556 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
523 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  30.8 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  32.4 
 
 
527 aa  139  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  27.34 
 
 
530 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
539 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  29.5 
 
 
532 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  29.31 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
555 aa  127  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  30.04 
 
 
530 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
516 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
531 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.94 
 
 
533 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
532 aa  124  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  27.5 
 
 
531 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.17 
 
 
510 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
549 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  31.63 
 
 
548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>