198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1398 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
469 aa  910    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  54.41 
 
 
470 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  47.32 
 
 
476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  50.32 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  46.57 
 
 
477 aa  435  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  47.64 
 
 
478 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  49.46 
 
 
474 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  52.79 
 
 
472 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  47.33 
 
 
484 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  54.11 
 
 
487 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  48.94 
 
 
472 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  44.73 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  50.2 
 
 
515 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  39.44 
 
 
476 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  47 
 
 
465 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 
466 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  52.35 
 
 
505 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  54.08 
 
 
474 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  49.36 
 
 
481 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  55.36 
 
 
474 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  46.47 
 
 
479 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  45.22 
 
 
506 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  54.72 
 
 
474 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  48.93 
 
 
484 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  49.37 
 
 
511 aa  368  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  44.83 
 
 
473 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  45.96 
 
 
491 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.14 
 
 
469 aa  350  4e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  46.58 
 
 
482 aa  348  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.96 
 
 
503 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.68 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
468 aa  331  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  44.14 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46 
 
 
477 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  44.14 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  43.5 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  43.92 
 
 
476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  43.5 
 
 
482 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  44.42 
 
 
482 aa  315  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  40.62 
 
 
496 aa  313  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 
487 aa  313  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 
491 aa  299  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  41.91 
 
 
524 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  49.44 
 
 
568 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
531 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 
534 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  37.42 
 
 
534 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.97 
 
 
545 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 
530 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 
528 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
526 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
530 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
530 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
560 aa  219  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  36.5 
 
 
437 aa  215  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 
528 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 
580 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  33.55 
 
 
531 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  34.94 
 
 
530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
531 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
523 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
533 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  29.31 
 
 
535 aa  150  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
510 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
528 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
554 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
523 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  28.6 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
554 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
547 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
559 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.23 
 
 
510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
524 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  30.17 
 
 
548 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
547 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
561 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
514 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
555 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
537 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  26.68 
 
 
529 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
547 aa  101  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
537 aa  99.8  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.28 
 
 
527 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.01 
 
 
564 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 
565 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  27.19 
 
 
533 aa  97.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  26.7 
 
 
530 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
533 aa  96.7  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  30.1 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  29.58 
 
 
545 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
530 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  29.9 
 
 
532 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  28.98 
 
 
526 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
516 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 
532 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>