More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2744 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  91.96 
 
 		 535 aa  951    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  81.5 
 
 		 536 aa  856    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  81.5 
 
 		 552 aa  857    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  82.14 
 
 		 537 aa  888    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  83.36 
 
 		 536 aa  878    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 535 aa  1072    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  63.43 
 
 		 533 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  65.33 
 
 		 547 aa  684    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  82.14 
 
 		 533 aa  886    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  66.73 
 
 		 527 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  59.51 
 
 		 537 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  59.66 
 
 		 549 aa  615  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  59.37 
 
 		 539 aa  609  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  41.17 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  45.68 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 516 aa  376  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 534 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  43.18 
 
 		 532 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  42.99 
 
 		 532 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  42.8 
 
 		 532 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  40.33 
 
 		 530 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  39.04 
 
 		 530 aa  319  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  35.66 
 
 		 530 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 		 531 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  37.55 
 
 		 531 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 		 531 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 554 aa  286  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 547 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 536 aa  259  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 547 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  32.77 
 
 		 556 aa  233  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 565 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 564 aa  229  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 561 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 556 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 		 532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 563 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 510 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 523 aa  204  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 527 aa  204  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  31.34 
 
 		 510 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 531 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.32 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  33.7 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 520 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 531 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 519 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 528 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  30.68 
 
 		 526 aa  149  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.11 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 530 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  30.35 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 		 517 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 551 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  26.92 
 
 		 536 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.71 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.67 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  28.22 
 
 		 465 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 516 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  28.24 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  30.37 
 
 		 529 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  33.39 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.02 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  29.41 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 430 aa  127  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.73 
 
 		 472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 528 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.75 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.99 
 
 		 470 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  29.68 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 506 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  27.2 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 513 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  30.07 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>