More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3854 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
530 aa  1076    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  54.68 
 
 
530 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  52.08 
 
 
531 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  52.08 
 
 
531 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  51.89 
 
 
531 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  42.99 
 
 
555 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  44.57 
 
 
536 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  40.08 
 
 
537 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 
547 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  39.92 
 
 
530 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 
539 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  41.87 
 
 
527 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 
518 aa  360  5e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 
549 aa  356  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 
533 aa  356  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  42.37 
 
 
532 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  42.37 
 
 
532 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  41.89 
 
 
532 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  39.37 
 
 
533 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 
537 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 
535 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 
536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 
535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 
552 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 
536 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 
534 aa  299  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  36.48 
 
 
554 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 
554 aa  289  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  34.66 
 
 
556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
559 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
547 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 
536 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
547 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
556 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
564 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
565 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
563 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
561 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
510 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
528 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
532 aa  225  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.58 
 
 
510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
514 aa  210  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  31.21 
 
 
510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  32.62 
 
 
545 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
523 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.24 
 
 
527 aa  177  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 
520 aa  174  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
523 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
531 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
520 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
520 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
519 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
528 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
527 aa  154  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
523 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
524 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
530 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  26.67 
 
 
536 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
474 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.31 
 
 
529 aa  146  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.55 
 
 
545 aa  143  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 
477 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
474 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
476 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
531 aa  139  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  30.46 
 
 
526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.74 
 
 
472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
430 aa  137  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
505 aa  136  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  29.3 
 
 
470 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.04 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
545 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  26.16 
 
 
476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
484 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
560 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
478 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
521 aa  123  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.06 
 
 
535 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  29.78 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
528 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  29.86 
 
 
504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  25.84 
 
 
479 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.37 
 
 
503 aa  107  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>