268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  100 
 
 
545 aa  1074    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  59.39 
 
 
534 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  63.81 
 
 
530 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 
534 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  55.92 
 
 
531 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  54.47 
 
 
530 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  54.47 
 
 
530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  54.47 
 
 
530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  53.44 
 
 
528 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  51.29 
 
 
526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  56.57 
 
 
580 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  51.39 
 
 
560 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  52.37 
 
 
528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  43.15 
 
 
524 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  41.52 
 
 
487 aa  287  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  38.22 
 
 
470 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 
506 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 
474 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 
474 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  38.05 
 
 
472 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  35.86 
 
 
465 aa  257  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
515 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  33 
 
 
476 aa  247  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  33.2 
 
 
476 aa  246  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 
478 aa  246  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
484 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
476 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 
523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 
481 aa  236  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  41.35 
 
 
474 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  36.35 
 
 
466 aa  230  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
505 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 
477 aa  226  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 
474 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.79 
 
 
469 aa  224  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  40.55 
 
 
474 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
491 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 
523 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 
472 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  33.4 
 
 
473 aa  206  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
468 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
554 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.2 
 
 
511 aa  201  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 
554 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 
559 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
484 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
522 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
556 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
533 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  31.69 
 
 
479 aa  189  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.95 
 
 
499 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
528 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
535 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
564 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.94 
 
 
503 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
487 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
491 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 
563 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
565 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
547 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.4 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  32.42 
 
 
482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
533 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
561 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  31.27 
 
 
482 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  31.27 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
547 aa  167  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  31.32 
 
 
533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 
539 aa  166  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  28.84 
 
 
556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  31.25 
 
 
480 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  30.62 
 
 
482 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
536 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  31.68 
 
 
527 aa  160  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
510 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 
555 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.41 
 
 
527 aa  151  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.63 
 
 
529 aa  150  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.06 
 
 
530 aa  150  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
549 aa  150  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  30.45 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  30.65 
 
 
491 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  30.65 
 
 
491 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  31.41 
 
 
437 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
552 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
536 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 
537 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
537 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.46 
 
 
531 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.65 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
531 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  32.46 
 
 
532 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
534 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
531 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>