More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1607 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 510 aa  1023    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  62.11 
 
 		 514 aa  600  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  59.22 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  58.8 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  48.67 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  45.57 
 
 		 559 aa  445  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  44.99 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  43.82 
 
 		 545 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  37.81 
 
 		 556 aa  352  8e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 547 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  39.32 
 
 		 551 aa  306  8.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  40.89 
 
 		 526 aa  299  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 565 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 561 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 564 aa  290  5.0000000000000004e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 		 556 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 563 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 516 aa  256  9e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 518 aa  253  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  31.67 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 539 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  33.96 
 
 		 527 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 533 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 545 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 530 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 536 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  30.62 
 
 		 530 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 547 aa  202  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  31.35 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 536 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 537 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  32.77 
 
 		 531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 		 537 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 536 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 531 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 		 531 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  32.57 
 
 		 530 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.16 
 
 		 532 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 535 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  31.98 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 532 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  33.15 
 
 		 535 aa  180  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.52 
 
 		 527 aa  178  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 523 aa  178  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 524 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 530 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 530 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 530 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 533 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 524 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 520 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 520 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 526 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 560 aa  150  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.36 
 
 		 545 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  28.94 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  29.65 
 
 		 472 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 481 aa  143  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 519 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.4 
 
 		 548 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 531 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  30.1 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  27.52 
 
 		 476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 487 aa  127  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 484 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 521 aa  123  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.92 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  27.38 
 
 		 479 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.63 
 
 		 499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.85 
 
 		 503 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  30.02 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>