253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13863 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  70.61 
 
 
520 aa  771    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  70.61 
 
 
520 aa  771    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  70.29 
 
 
520 aa  774    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  70.99 
 
 
520 aa  776    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  100 
 
 
536 aa  1097    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  69.52 
 
 
519 aa  767    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  57.58 
 
 
528 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
547 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
555 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
554 aa  160  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
537 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.99 
 
 
527 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 
518 aa  153  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.15 
 
 
531 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
531 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
547 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
533 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.18 
 
 
533 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
536 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
537 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
564 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
547 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
552 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
539 aa  136  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  27.06 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
536 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
565 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  27.61 
 
 
556 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
530 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  25.37 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
532 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
556 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
534 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
563 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
535 aa  115  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
561 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  26.53 
 
 
532 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  26.53 
 
 
532 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
536 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
517 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  25.56 
 
 
510 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
545 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.91 
 
 
510 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
532 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
527 aa  101  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.02 
 
 
512 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  28 
 
 
545 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  23.84 
 
 
512 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 
533 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 
506 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
551 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
523 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  23.93 
 
 
506 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 
430 aa  92  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.37 
 
 
472 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  25.83 
 
 
508 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  25.96 
 
 
548 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  26.06 
 
 
526 aa  86.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24.64 
 
 
508 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.25 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
497 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.91 
 
 
498 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  24.59 
 
 
535 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
497 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  24.59 
 
 
522 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 
474 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
531 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  23.39 
 
 
516 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  26.8 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  24.63 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  25.41 
 
 
492 aa  73.6  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.01 
 
 
545 aa  73.6  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
503 aa  73.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.47 
 
 
503 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  24.84 
 
 
507 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  23.5 
 
 
509 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.06 
 
 
532 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
521 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  23.92 
 
 
527 aa  70.1  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 
505 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.76 
 
 
493 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>