118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5019 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  73.49 
 
 		 499 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  73.49 
 
 		 499 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1035    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  73.49 
 
 		 499 aa  670    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  78.39 
 
 		 520 aa  756    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  66.14 
 
 		 535 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  62.64 
 
 		 529 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  53.24 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  56.05 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.62 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  52.19 
 
 		 516 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.38 
 
 		 523 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  50.76 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  47.08 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.81 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  45.86 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 534 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 536 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  29.49 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 547 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 552 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  29.8 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 535 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 549 aa  127  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 533 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 523 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.55 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  30.46 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  30.28 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 516 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 532 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 539 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  25.54 
 
 		 530 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 536 aa  94.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 531 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  25.77 
 
 		 531 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  22.18 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.83 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 564 aa  67  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 517 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  25.24 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  26.59 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.83 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  26.57 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  23.26 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  26.82 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  26.49 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 532 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.09 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 		 563 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  66.67 
 
 		 548 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  62.5 
 
 		 554 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  60.87 
 
 		 521 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  57.89 
 
 		 527 aa  51.6  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 568 aa  51.2  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 547 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  21.97 
 
 		 476 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 524 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  60.98 
 
 		 561 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  28.43 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  28.43 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  28.43 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  61.11 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  52.73 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.1 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  22.59 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  57.5 
 
 		 556 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  23.75 
 
 		 465 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 547 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 469 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 524 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 530 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 530 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>