72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4539 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  73.4 
 
 		 520 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1003    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  73.49 
 
 		 516 aa  718    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1003    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1003    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  65.35 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  61.72 
 
 		 529 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  53.53 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  54.37 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  50.97 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  47.97 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  50.1 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.64 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.47 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.93 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 		 522 aa  316  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 534 aa  120  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 523 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.65 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 549 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 536 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 531 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  28.89 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 552 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 536 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  27.05 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 527 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 533 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 539 aa  97.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 516 aa  97.1  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 518 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  29.28 
 
 		 532 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  29.09 
 
 		 532 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  24.49 
 
 		 530 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 535 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  25.1 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 530 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.51 
 
 		 510 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  27.09 
 
 		 545 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  22.62 
 
 		 556 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 532 aa  50.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 568 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  28.39 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  28.39 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  28.39 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 		 510 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 514 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  25.42 
 
 		 465 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  22.33 
 
 		 554 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  21.54 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  27.58 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  28.05 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 551 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 517 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 506 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>