282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1761 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  100 
 
 
530 aa  1017    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  63.71 
 
 
545 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  59.39 
 
 
534 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  57.62 
 
 
531 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  59.59 
 
 
534 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  51.15 
 
 
530 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  58.01 
 
 
580 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  50.38 
 
 
530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  50.38 
 
 
530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  51.71 
 
 
528 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  48.91 
 
 
560 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  50.1 
 
 
526 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 
528 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  44.29 
 
 
524 aa  307  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 
487 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
506 aa  267  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
474 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  36.06 
 
 
465 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
476 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  33.53 
 
 
476 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  35.83 
 
 
478 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
515 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  32.93 
 
 
476 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  36.04 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
523 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  36.44 
 
 
472 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
484 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 
481 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 
477 aa  226  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
472 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
533 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 
474 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 
469 aa  217  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  41.5 
 
 
474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  35.12 
 
 
473 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.23 
 
 
469 aa  208  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
491 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
468 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.07 
 
 
477 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.88 
 
 
499 aa  200  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.35 
 
 
511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  34.25 
 
 
479 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
556 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
564 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
554 aa  191  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  31.91 
 
 
535 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
554 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
523 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.65 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  35.49 
 
 
482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
487 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 
559 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
547 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
531 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
522 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  33.59 
 
 
482 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
563 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  32.41 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 
491 aa  173  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
531 aa  173  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 
561 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  47.58 
 
 
474 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
528 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  32.68 
 
 
482 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
524 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  33.72 
 
 
496 aa  167  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  32.24 
 
 
476 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  32.24 
 
 
491 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  32.24 
 
 
491 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
539 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
547 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  32.71 
 
 
533 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  32.34 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
536 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.26 
 
 
510 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
549 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.98 
 
 
527 aa  144  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
534 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
523 aa  140  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
514 aa  139  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
537 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  33.02 
 
 
532 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  33.02 
 
 
532 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
552 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
537 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  30.97 
 
 
531 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
536 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
531 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  27.46 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
531 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>