293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1146 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  965    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  63.41 
 
 
485 aa  640    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1151  hypothetical protein  82 
 
 
465 aa  811    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  97.44 
 
 
468 aa  947    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  96.79 
 
 
468 aa  943    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  38.32 
 
 
476 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  40.5 
 
 
484 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3186  hypothetical protein  42.92 
 
 
239 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834271  hitchhiker  0.00173246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  40.88 
 
 
245 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  21.16 
 
 
425 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
554 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  26.42 
 
 
470 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  29.88 
 
 
468 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  21.59 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  52 
 
 
488 aa  58.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  21.22 
 
 
503 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.72 
 
 
511 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 
559 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.41 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 
554 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  23.68 
 
 
506 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.72 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  40 
 
 
449 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  45.1 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  44.26 
 
 
433 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  50 
 
 
421 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 
547 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  26.6 
 
 
431 aa  53.5  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  40.26 
 
 
447 aa  53.5  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  37.35 
 
 
428 aa  53.1  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  35.8 
 
 
505 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
551 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  40 
 
 
502 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  35.16 
 
 
496 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  47.06 
 
 
463 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  46.15 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  40 
 
 
502 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  46.15 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  31.65 
 
 
495 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  36.25 
 
 
525 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  31.43 
 
 
438 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  41.82 
 
 
426 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  37.84 
 
 
505 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  31.65 
 
 
495 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 
523 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  24.19 
 
 
471 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  35.29 
 
 
434 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  23.26 
 
 
463 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  46.55 
 
 
512 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  43.14 
 
 
437 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  46.55 
 
 
512 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  46.55 
 
 
512 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  46.15 
 
 
524 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  44.23 
 
 
437 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  33.78 
 
 
501 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  39.29 
 
 
537 aa  50.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  36.59 
 
 
556 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  43.1 
 
 
506 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  41.38 
 
 
506 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
510 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  43.64 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  44.23 
 
 
480 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
488 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 
547 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  46.55 
 
 
507 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  44 
 
 
497 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  39.13 
 
 
503 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  36.84 
 
 
505 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  36.84 
 
 
505 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  36.11 
 
 
508 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
510 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  45.83 
 
 
437 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  43.14 
 
 
516 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  25.96 
 
 
488 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
496 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
534 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  47.06 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  22.68 
 
 
503 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  35.53 
 
 
435 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  43.1 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  43.14 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  28.46 
 
 
436 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  31.17 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  44.23 
 
 
507 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  36.36 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  42 
 
 
501 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 
536 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  20.58 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5081  glucose-inhibited division protein A  35.9 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.880262 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  27.05 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  27.87 
 
 
436 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  20.92 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  27.05 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3708  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
494 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0275457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  20.9 
 
 
509 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  21.46 
 
 
514 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.26 
 
 
488 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  26.36 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  43.9 
 
 
408 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>