221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3364 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  100 
 
 		 414 aa  786    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  49.5 
 
 		 407 aa  312  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  47.2 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  47.69 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  45.57 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  44.6 
 
 		 451 aa  242  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  42.89 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  39.9 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  35.68 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  46.17 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  35.97 
 
 		 438 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  32.63 
 
 		 470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  39.13 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  38.6 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  35.53 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  38.65 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  36.34 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  35.53 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  40.99 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  34.86 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  35.64 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  34.61 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  33.97 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  32.94 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  35.6 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  36.34 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  33.96 
 
 		 431 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  31.39 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  33.08 
 
 		 413 aa  93.2  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.63 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  29.75 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.52 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  29.05 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  29.06 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  31.11 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.63 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.84 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.63 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.63 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.63 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.19 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  28.46 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  28.77 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  28.77 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 		 490 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.84 
 
 		 487 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.58 
 
 		 485 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.58 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 		 490 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  48.48 
 
 		 949 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  23.86 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  28.18 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  46.88 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  48.57 
 
 		 503 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  29.04 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  23.86 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  51.72 
 
 		 509 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  49.06 
 
 		 245 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  51.02 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  46.97 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  53.57 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.48 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  29.72 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  54 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  26.46 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  46.75 
 
 		 506 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  45.28 
 
 		 525 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  36.67 
 
 		 469 aa  50.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  23.43 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  23.86 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  23.86 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  23.86 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  54 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  26.2 
 
 		 429 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  23.86 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  51.79 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  42.65 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  51.79 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  52 
 
 		 519 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.21 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  51.79 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  28.28 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  41.18 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  23.86 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  32.58 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  26.92 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  43.9 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  44.44 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  24.12 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.78 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  26.92 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  25.35 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  43.9 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  26.92 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  43.4 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  41.18 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>