143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0507 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
342 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  97.37 
 
 
342 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  96.2 
 
 
342 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  27.87 
 
 
359 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
351 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 
330 aa  99.4  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
346 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
354 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
358 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  31.05 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
383 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
361 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  32.84 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  32.34 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  30.89 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  31.47 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  32.02 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.38 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  27.98 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  27.49 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  27.78 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  31.82 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  30.59 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
407 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  30.09 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  27.68 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  26.59 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  31.55 
 
 
348 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
347 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  28.61 
 
 
843 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  29.91 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 
369 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  43.24 
 
 
479 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.51 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  26.2 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  37.88 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  36.99 
 
 
434 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  43.14 
 
 
484 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  41.18 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  24.1 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  45 
 
 
438 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  44 
 
 
476 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  45.16 
 
 
450 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  40 
 
 
426 aa  49.7  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  45.16 
 
 
450 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  45.45 
 
 
445 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  46.43 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.62 
 
 
501 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  43.94 
 
 
451 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  29.95 
 
 
2162 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
510 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  34.04 
 
 
459 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  50 
 
 
447 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  29.63 
 
 
599 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  41.07 
 
 
508 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  42.47 
 
 
423 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  41.07 
 
 
507 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  45 
 
 
448 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  39.29 
 
 
505 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  31.91 
 
 
474 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  21.91 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  40.26 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  31.91 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 
446 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  44.64 
 
 
445 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  45.1 
 
 
383 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  31.91 
 
 
466 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  31.91 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  31.91 
 
 
466 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  32.41 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  31.91 
 
 
471 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  35.59 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  28.57 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  32.32 
 
 
392 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  43.24 
 
 
420 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  44.29 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  36.67 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  32.98 
 
 
479 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  28.48 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  33.64 
 
 
589 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
554 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  50 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>