65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2101 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  68.46 
 
 
454 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  100 
 
 
452 aa  937    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  52.14 
 
 
449 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  50.11 
 
 
452 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  40 
 
 
532 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  42.06 
 
 
538 aa  349  6e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  30.16 
 
 
1293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  32.71 
 
 
431 aa  220  5e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  28.08 
 
 
428 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  28.1 
 
 
435 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  27.64 
 
 
437 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  27.48 
 
 
447 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  27.07 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  29.24 
 
 
450 aa  145  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  27.4 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  27.01 
 
 
449 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  27.01 
 
 
446 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  26.56 
 
 
472 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  25.43 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  24.67 
 
 
496 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  25.64 
 
 
500 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  26.44 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  25 
 
 
512 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  25.71 
 
 
427 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  25.32 
 
 
520 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  25.99 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25.32 
 
 
511 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  25.59 
 
 
500 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  25.92 
 
 
524 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.38 
 
 
467 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25.05 
 
 
500 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  23.96 
 
 
494 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  22.9 
 
 
498 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  23.42 
 
 
511 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  26.13 
 
 
516 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  25.76 
 
 
465 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  24.17 
 
 
549 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  26.19 
 
 
463 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.32 
 
 
424 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  26.19 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  26.19 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  23.34 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.53 
 
 
1033 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  24.56 
 
 
519 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.54 
 
 
431 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.39 
 
 
722 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  23.45 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  22.59 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  23.9 
 
 
538 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.03 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.81 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  29.76 
 
 
491 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  22.48 
 
 
539 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 
450 aa  63.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  21.99 
 
 
537 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  27.81 
 
 
437 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  31.13 
 
 
502 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  31.13 
 
 
502 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.32 
 
 
471 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  56.82 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4557  hypothetical protein  23.2 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159105  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  38.46 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  21.01 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>