13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4557 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4557  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  916    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159105  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  51.93 
 
 
443 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.65 
 
 
471 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  23.33 
 
 
507 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  20.32 
 
 
480 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  21.02 
 
 
512 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  21.84 
 
 
447 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  19.56 
 
 
496 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  24.15 
 
 
511 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  23.2 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  41.27 
 
 
518 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  38.67 
 
 
520 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  37.1 
 
 
556 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>