61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2901 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  884    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  99.06 
 
 		 427 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  35.41 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  28.08 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25.3 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  28.27 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  26 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  26.96 
 
 		 1293 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  26.52 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  25.89 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.35 
 
 		 435 aa  126  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  24.31 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  24.47 
 
 		 437 aa  123  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  23.89 
 
 		 452 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.26 
 
 		 538 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  20.65 
 
 		 532 aa  99.8  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  21.88 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  24.44 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  22.61 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  21.78 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  21.4 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  22.07 
 
 		 516 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  21.63 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.97 
 
 		 722 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  21.13 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  18.82 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  22.54 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  21.32 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  20.5 
 
 		 520 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  20.86 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  19.57 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  20.94 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.42 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  20.71 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  20.71 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  19.91 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  21.88 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  20.59 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  20.99 
 
 		 500 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  19.71 
 
 		 500 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  20.71 
 
 		 549 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  20.26 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  20.86 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  19.67 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  19.69 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  20.3 
 
 		 537 aa  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  19.82 
 
 		 459 aa  49.7  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  20.43 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  46.81 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  19.83 
 
 		 539 aa  46.6  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  41.18 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  20.51 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  21.43 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  37.93 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 509 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  17.29 
 
 		 489 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 484 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  28.57 
 
 		 470 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  18.22 
 
 		 519 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  29.87 
 
 		 476 aa  43.1  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>