67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0375 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  862    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  49.65 
 
 
450 aa  414  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  37.92 
 
 
435 aa  272  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  33.94 
 
 
449 aa  237  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  34.85 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  34.66 
 
 
436 aa  229  9e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  34.77 
 
 
437 aa  227  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  34.16 
 
 
446 aa  224  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  26.27 
 
 
431 aa  162  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  28.44 
 
 
454 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.8 
 
 
1293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  27.4 
 
 
452 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
460 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  24.71 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 
532 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  27.34 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  27.84 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  27.45 
 
 
538 aa  126  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  26.88 
 
 
512 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  27.17 
 
 
507 aa  123  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  27.25 
 
 
496 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25.85 
 
 
511 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.28 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  27.51 
 
 
467 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  25.41 
 
 
421 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  26.23 
 
 
480 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  24.95 
 
 
498 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  26.36 
 
 
500 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25.97 
 
 
500 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  26.71 
 
 
516 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  26.27 
 
 
500 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  22.86 
 
 
427 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  25.43 
 
 
511 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  22.86 
 
 
427 aa  100  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  22.98 
 
 
472 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  26.17 
 
 
524 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  22.64 
 
 
494 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  25.49 
 
 
465 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  27.03 
 
 
520 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  24.21 
 
 
459 aa  86.3  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  22.9 
 
 
549 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.21 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  25.39 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  25.39 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  24.77 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.19 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  21.63 
 
 
519 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  27.78 
 
 
436 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  23.45 
 
 
537 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.33 
 
 
722 aa  63.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  23.11 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  21.6 
 
 
538 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.5 
 
 
1033 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
450 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  22.79 
 
 
539 aa  55.1  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 
453 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  22.46 
 
 
429 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  26.3 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  25.71 
 
 
488 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 
443 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  24.86 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.16 
 
 
491 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  24.14 
 
 
367 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  26.11 
 
 
366 aa  43.5  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  22.28 
 
 
363 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>