246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7546 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 489 aa  996    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  52.31 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  29.64 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  26.67 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  26.51 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  27.16 
 
 		 498 aa  144  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  23.86 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  27.04 
 
 		 524 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  28.12 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25.4 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  25.71 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  26.94 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  20.77 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  25.3 
 
 		 500 aa  127  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  23.7 
 
 		 480 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  26.64 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  24.7 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  22.83 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  22.87 
 
 		 465 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  26.45 
 
 		 465 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.62 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  23.23 
 
 		 549 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  21.63 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.33 
 
 		 1033 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.74 
 
 		 722 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  24.65 
 
 		 436 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  25.69 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  25.69 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  25.69 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.79 
 
 		 435 aa  91.3  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  22.78 
 
 		 537 aa  89.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25.61 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  25.77 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  24.55 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  28.29 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  20.52 
 
 		 538 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  24.13 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  20.67 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.08 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  21.46 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  27.93 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  22.37 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  24.08 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  20.97 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  23.84 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  46.81 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  22.54 
 
 		 538 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  21.68 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  46.55 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1811  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 321 aa  53.9  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000441669  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  30.95 
 
 		 476 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  22.27 
 
 		 431 aa  53.5  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  28.75 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  41.76 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  37.59 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  41.76 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  46.27 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.87 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  41.89 
 
 		 533 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  27.33 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  43.64 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  26.47 
 
 		 506 aa  50.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  43.64 
 
 		 245 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  30.08 
 
 		 552 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  25.67 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  41.98 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  38.2 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  34.25 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  24.68 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 		 539 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  41.98 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  25.3 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  41.98 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  56.36 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  42.39 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  45.9 
 
 		 530 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.17 
 
 		 618 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  22.96 
 
 		 1293 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  25.7 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  40.24 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.62 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  44.9 
 
 		 497 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  36.36 
 
 		 468 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  46.15 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  27.83 
 
 		 396 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 537 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 		 547 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  16.77 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.68 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  34.55 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  39.76 
 
 		 525 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  36.36 
 
 		 504 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  20.86 
 
 		 525 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  25.51 
 
 		 501 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>