270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01726 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  100 
 
 		 344 aa  685    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  49.84 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  46.58 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  38.53 
 
 		 328 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  38.31 
 
 		 328 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  37.11 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  38.64 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  38.31 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  38.23 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  37.42 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  38.31 
 
 		 328 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  38.12 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  38.15 
 
 		 324 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  35.4 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  35.33 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  36.2 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  36.19 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  31.84 
 
 		 843 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 407 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 360 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 369 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 367 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.26 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  30.12 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  29.27 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  24.4 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.08 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  28.44 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.34 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  27.6 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.28 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  23.68 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  25.48 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  33.56 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  43.28 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  25.98 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  44.29 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  53.33 
 
 		 1487 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  23.77 
 
 		 484 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  33.98 
 
 		 504 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.63 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  44.44 
 
 		 448 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  39.24 
 
 		 485 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  40.51 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.32 
 
 		 478 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  49.12 
 
 		 519 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  38.27 
 
 		 504 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  39.74 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0301  putative oxidoreductase  37.5 
 
 		 487 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.456706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  39.74 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  39.74 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  35 
 
 		 491 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  40.91 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.11 
 
 		 482 aa  49.7  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  60.98 
 
 		 658 aa  49.7  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.71 
 
 		 579 aa  49.7  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  41.1 
 
 		 516 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  40 
 
 		 523 aa  49.3  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  38.03 
 
 		 647 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  32.91 
 
 		 494 aa  49.3  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  38.03 
 
 		 647 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  35.48 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  33.65 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  44.07 
 
 		 499 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  51.22 
 
 		 472 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  35.8 
 
 		 489 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  33.06 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  56.1 
 
 		 491 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  35.8 
 
 		 489 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  35.48 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  52.38 
 
 		 488 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  54.17 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  35.8 
 
 		 492 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  24.56 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  54.76 
 
 		 488 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  43.1 
 
 		 498 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>